ISAR/libmdbx
3
0
Fork 0
mirror of https://github.com/isar/libmdbx.git synced 2024-10-29 23:19:20 +08:00
Code Issues Packages Projects Releases Wiki Activity

mdbx: refine README.

Browse Source 
Change-Id: Ib548c994753ab619ea8c813531b81a562f9d21fd
This commit is contained in:
Leo Yuriev 2018-07-30 02:55:13 +03:00
parent dbf66ec0bb
commit dd4da591af
2 changed files with 860 additions and 758 deletions
Show Stats Download Patch File Download Diff File Expand all files Collapse all files

860
README-RU.md
View File

@ -12,31 +12,31 @@ and [by Yandex](https://translate.yandex.ru/translate?url=https%3A%2F%2Fgithub.c
### Project Status
**Сейчас MDBX _активно перерабатывается_** и к середине 2018 ожидается
большое изменение как API, так и формата базы данных. К сожалению,
обновление приведет к потере совместимости с предыдущими версиями.
**Сейчас MDBX _активно перерабатывается_** и к середине 2018
ожидается большое изменение как API, так и формата базы данных.
К сожалению, обновление приведет к потере совместимости с
предыдущими версиями.
Цель этой революции - обеспечение более четкого надежного API и
добавление новых функции, а также наделение базы данных новыми
свойствами.
Цель этой революции - обеспечение более четкого надежного
API и добавление новых функции, а также наделение базы данных
новыми свойствами.
В настоящее время MDBX предназначена для Linux, а также
поддерживает Windows (начиная с Windows Server 2008) в качестве
дополнительной платформы. Поддержка других ОС может быть
обеспечена на коммерческой основе. Однако такие
усовершенствования (т. е. pull-requests) могут быть приняты в
мейнстрим только в том случае, если будет доступен
соответствующий публичный и бесплатный сервис непрерывной
интеграции (aka Continuous Integration).
В настоящее время MDBX предназначена для Linux, а также поддерживает
Windows (начиная с Windows Server 2008) в качестве дополнительной
платформы. Поддержка других ОС может быть обеспечена на коммерческой
основе. Однако такие усовершенствования (т. е. pull-requests) могут быть
приняты в мейнстрим только в том случае, если будет доступен
соответствующий публичный и бесплатный сервис непрерывной интеграции
(aka Continuous Integration).
## Содержание
- [Обзор](#Обзор)
- [Сравнение с другими СУБД](#Сравнение-с-другими-СУБД)
- [История & Acknowledgments](#История)
- [Основные свойства](#Основные-свойства)
- [Доработки и усовершенствования относительно LMDB](#Доработки-и-усовершенствования-относительно-lmdb)
- [Недостатки и Компромиссы](#Недостатки-и-Компромиссы)
- [Проблема долгих чтений](#Проблема-долгих-чтений)
- [Сохранность данных в режиме асинхронной фиксации](#Сохранность-данных-в-режиме-асинхронной-фиксации)
- [Сравнение производительности](#Сравнение-производительности)
- [Интегральная производительность](#Интегральная-производительность)
- [Масштабируемость чтения](#Масштабируемость-чтения)
@ -44,21 +44,18 @@ API и добавление новых функции, а также надел
- [Отложенная фиксация](#Отложенная-фиксация)
- [Асинхронная фиксация](#Асинхронная-фиксация)
- [Потребление ресурсов](#Потребление-ресурсов)
- [Недостатки и Компромиссы](#Недостатки-и-Компромиссы)
- [Проблема долгих чтений](#Проблема-долгих-чтений)
- [Сохранность данных в режиме асинхронной фиксации](#Сохранность-данных-в-режиме-асинхронной-фиксации)
- [Доработки и усовершенствования относительно LMDB](#Доработки-и-усовершенствования-относительно-lmdb)
## Обзор
_libmdbx_ - это встраиваемый key-value движок хранения со специфическим
набором свойств и возможностей, ориентированный на создание уникальных
легковесных решений с предельной производительностью под Linux и Windows.
легковесных решений с предельной производительностью под Linux и
Windows.
_libmdbx_ позволяет множеству процессов совместно читать и обновлять
несколько key-value таблиц с соблюдением [ACID](https://ru.wikipedia.org/wiki/ACID),
при минимальных накладных расходах и амортизационной стоимости любых операций Olog(N).
несколько key-value таблиц с соблюдением
[ACID](https://ru.wikipedia.org/wiki/ACID), при минимальных накладных
расходах и амортизационной стоимости любых операций Olog(N).
_libmdbx_ обеспечивает
[serializability](https://en.wikipedia.org/wiki/Serializability)
@ -72,20 +69,26 @@ _libmdbx_ позволяет выполнять операции чтения с
параллельно на каждом ядре CPU, без использования атомарных операций
и/или примитивов синхронизации.
_libmdbx_ не использует [LSM](https://en.wikipedia.org/wiki/Log-structured_merge-tree), а основан на [B+Tree](https://en.wikipedia.org/wiki/B%2B_tree) с [отображением](https://en.wikipedia.org/wiki/Memory-mapped_file) всех данных в память,
при этом текущая версия не использует [WAL](https://en.wikipedia.org/wiki/Write-ahead_logging).
Это предопределяет многие свойства, в том числе удачные и противопоказанные сценарии использования.
_libmdbx_ не использует
[LSM](https://en.wikipedia.org/wiki/Log-structured_merge-tree), а
основан на [B+Tree](https://en.wikipedia.org/wiki/B%2B_tree) с
[отображением](https://en.wikipedia.org/wiki/Memory-mapped_file) всех
данных в память, при этом текущая версия не использует
[WAL](https://en.wikipedia.org/wiki/Write-ahead_logging). Это
предопределяет многие свойства, в том числе удачные и противопоказанные
сценарии использования.
### Сравнение с другими СУБД
Ввиду того, что в _libmdbx_ сейчас происходит революция, я посчитал лучшим решением
ограничится здесь ссылкой на [главу Comparison with other databases](https://github.com/coreos/bbolt#comparison-with-other-databases) в описании _BoltDB_.
Ввиду того, что в _libmdbx_ сейчас происходит революция, я посчитал
лучшим решением ограничится здесь ссылкой на [главу Comparison with
other databases](https://github.com/coreos/bbolt#comparison-with-other-databases)
в описании _BoltDB_.
### История
_libmdbx_ является результатом переработки и развития "Lightning Memory-Mapped Database",
известной под аббревиатурой
_libmdbx_ является результатом переработки и развития "Lightning
Memory-Mapped Database", известной под аббревиатурой
[LMDB](https://en.wikipedia.org/wiki/Lightning_Memory-Mapped_Database).
Изначально доработка производилась в составе проекта
[ReOpenLDAP](https://github.com/leo-yuriev/ReOpenLDAP). Примерно за год
@ -102,63 +105,410 @@ Technologies](https://www.ptsecurity.ru).
#### Acknowledgments
Howard Chu (Symas Corporation) - the author of LMDB, from which
originated the MDBX in 2015.
Howard Chu (Symas Corporation) - the author of LMDB,
from which originated the MDBX in 2015.
Martin Hedenfalk <martin@bzero.se> - the author of `btree.c` code,
which was used for begin development of LMDB.
Martin Hedenfalk <martin@bzero.se> - the author of `btree.c` code, which
was used for begin development of LMDB.
Основные свойства
=================
_libmdbx_ наследует все ключевые возможности и особенности
своего прародителя [LMDB](https://en.wikipedia.org/wiki/Lightning_Memory-Mapped_Database),
но с устранением ряда описываемых далее проблем и архитектурных недочетов.
_libmdbx_ наследует все ключевые возможности и особенности своего
прародителя
[LMDB](https://en.wikipedia.org/wiki/Lightning_Memory-Mapped_Database),
но с устранением ряда описываемых далее проблем и архитектурных
недочетов.
1. Данные хранятся в упорядоченном отображении (ordered map), ключи всегда
отсортированы, поддерживается выборка диапазонов (range lookups).
1. Данные хранятся в упорядоченном отображении (ordered map), ключи
всегда отсортированы, поддерживается выборка диапазонов (range lookups).
2. Данные отображается в память каждого работающего с БД процесса.
К данным и ключам обеспечивается прямой доступ в памяти без необходимости их
копирования.
2. Данные отображается в память каждого работающего с БД процесса. К
данным и ключам обеспечивается прямой доступ в памяти без необходимости
их копирования.
3. Транзакции согласно
[ACID](https://ru.wikipedia.org/wiki/ACID), посредством
[MVCC](https://ru.wikipedia.org/wiki/MVCC) и
[COW](https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%9A%D0%BE%D0%BF%D0%B8%D1%80%D0%BE%D0%B2%D0%B0%D0%BD%D0%B8%D0%B5_%D0%BF%D1%80%D0%B8_%D0%B7%D0%B0%D0%BF%D0%B8%D1%81%D0%B8).
Изменения строго последовательны и не блокируются чтением,
конфликты между транзакциями невозможны.
При этом гарантируется чтение только зафиксированных данных, см [relaxing serializability](https://en.wikipedia.org/wiki/Serializability).
3. Транзакции согласно [ACID](https://ru.wikipedia.org/wiki/ACID),
посредством [MVCC](https://ru.wikipedia.org/wiki/MVCC) и
[COW](https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%9A%D0%BE%D0%BF%D0%B8%D1%80%D0%BE%D0%B2%D0%B0%D0%BD%D0%B8%D0%B5_%D0%BF%D1%80%D0%B8_%D0%B7%D0%B0%D0%BF%D0%B8%D1%81%D0%B8).
Изменения строго последовательны и не блокируются чтением, конфликты
между транзакциями невозможны. При этом гарантируется чтение только
зафиксированных данных, см [relaxing
serializability](https://en.wikipedia.org/wiki/Serializability).
4. Чтение и поиск [без блокировок](https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%9D%D0%B5%D0%B1%D0%BB%D0%BE%D0%BA%D0%B8%D1%80%D1%83%D1%8E%D1%89%D0%B0%D1%8F_%D1%81%D0%B8%D0%BD%D1%85%D1%80%D0%BE%D0%BD%D0%B8%D0%B7%D0%B0%D1%86%D0%B8%D1%8F),
без [атомарных операций](https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%90%D1%82%D0%BE%D0%BC%D0%B0%D1%80%D0%BD%D0%B0%D1%8F_%D0%BE%D0%BF%D0%B5%D1%80%D0%B0%D1%86%D0%B8%D1%8F).
Читатели не блокируются операциями записи и не конкурируют
между собой, чтение масштабируется линейно по ядрам CPU.
4. Чтение и поиск [без
блокировок](https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%9D%D0%B5%D0%B1%D0%BB%D0%BE%D0%BA%D0%B8%D1%80%D1%83%D1%8E%D1%89%D0%B0%D1%8F_%D1%81%D0%B8%D0%BD%D1%85%D1%80%D0%BE%D0%BD%D0%B8%D0%B7%D0%B0%D1%86%D0%B8%D1%8F),
без [атомарных
операций](https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%90%D1%82%D0%BE%D0%BC%D0%B0%D1%80%D0%BD%D0%B0%D1%8F_%D0%BE%D0%BF%D0%B5%D1%80%D0%B0%D1%86%D0%B8%D1%8F).
Читатели не блокируются операциями записи и не конкурируют между собой,
чтение масштабируется линейно по ядрам CPU.
> Для точности следует отметить, что "подключение к БД" (старт первой
> читающей транзакции в потоке) и "отключение от БД" (закрытие БД или
> завершение потока) требуют краткосрочного захвата блокировки для
> регистрации/дерегистрации текущего потока в "таблице читателей".
5. Эффективное хранение дубликатов (ключей с несколькими
значениями), без дублирования ключей, с сортировкой значений, в
том числе целочисленных (для вторичных индексов).
5. Эффективное хранение дубликатов (ключей с несколькими значениями),
без дублирования ключей, с сортировкой значений, в том числе
целочисленных (для вторичных индексов).
6. Эффективная поддержка коротких ключей фиксированной длины, в том числе целочисленных.
6. Эффективная поддержка коротких ключей фиксированной длины, в том
числе целочисленных.
7. Амортизационная стоимость любой операции Olog(N),
[WAF](https://en.wikipedia.org/wiki/Write_amplification) (Write
Amplification Factor) и RAF (Read Amplification Factor) также Olog(N).
8. Нет [WAL](https://en.wikipedia.org/wiki/Write-ahead_logging) и
журнала транзакций, после сбоев не требуется восстановление. Не
требуется компактификация или какое-либо периодическое обслуживание.
Поддерживается резервное копирование "по горячему", на работающей БД без
приостановки изменения данных.
9. Отсутствует какое-либо внутреннее управление памятью или
кэшированием. Всё необходимое штатно выполняет ядро ОС.
Доработки и усовершенствования относительно LMDB
================================================
1. Утилита `mdbx_chk` для проверки целостности структуры БД.
2. Автоматическое динамическое управление размером БД согласно
параметрам задаваемым функцией `mdbx_env_set_geometry()`, включая шаг
приращения и порог уменьшения размера БД, а также выбор размера
страницы. Соответственно, это позволяет снизить фрагментированность
файла БД на диске и освободить место, в том числе в **Windows**.
3. Автоматическая без-затратная компактификация БД путем возврата
освобождающихся страниц в область нераспределенного резерва в конце
файла данных. При этом уменьшается количество страниц находящихся в
памяти и участвующих в в обмене с диском.
4. Поддержка ключей и значений нулевой длины, включая сортированные
дубликаты.
5. Возможность связать с каждой завершаемой транзакцией до 3
дополнительных маркеров посредством `mdbx_canary_put()`, и прочитать их
в транзакции чтения посредством `mdbx_canary_get()`.
6. Возможность посредством `mdbx_replace()` обновить или удалить запись
с получением предыдущего значения данных, а также адресно изменить
конкретное multi-значение.
7. Режим `LIFO RECLAIM`.
Для повторного использования выбираются не самые старые, а
самые новые страницы из доступных. За счет этого цикл
использования страниц всегда имеет минимальную длину и не
зависит от общего числа выделенных страниц.
В результате механизмы кэширования и обратной записи работают с
максимально возможной эффективностью. В случае использования
контроллера дисков или системы хранения с
[BBWC](https://en.wikipedia.org/wiki/BBWC) возможно
многократное увеличение производительности по записи
(обновлению данных).
8. Генерация последовательностей посредством `mdbx_dbi_sequence()`.
9. Обработчик `OOM-KICK`.
Посредством `mdbx_env_set_oomfunc()` может быть установлен
внешний обработчик (callback), который будет вызван при
исчерпании свободных страниц по причине долгой операцией чтения
на фоне интенсивного изменения данных.
Обработчику будет передан PID и pthread_id виновника.
В свою очередь обработчик может предпринять одно из действий:
* нейтрализовать виновника (отправить сигнал kill #9), если
долгое чтение выполняется сторонним процессом;
* отменить или перезапустить проблемную операцию чтения, если
операция выполняется одним из потоков текущего процесса;
* подождать некоторое время, в расчете на то, что проблемная операция
чтения будет штатно завершена;
* прервать текущую операцию изменения данных с возвратом кода
ошибки.
10. Возможность открыть БД в эксклюзивном режиме посредством флага
`MDBX_EXCLUSIVE`.
11. Возможность получить отставание текущей транзакции чтения от
последней версии данных в БД посредством `mdbx_txn_straggler()`.
12. Возможность явно запросить обновление существующей записи, без
создания новой посредством флажка `MDBX_CURRENT` для `mdbx_put()`.
13. Исправленный вариант `mdbx_cursor_count()`, возвращающий корректное
количество дубликатов для всех типов таблиц и любого положения курсора.
14. Возможность получить посредством `mdbx_env_info()` дополнительную
информацию, включая номер самой старой версии БД (снимка данных),
который используется одним из читателей.
15. Функция `mdbx_del()` не игнорирует дополнительный (уточняющий)
аргумент `data` для таблиц без дубликатов (без флажка `MDBX_DUPSORT`), а
при его ненулевом значении всегда использует его для сверки с удаляемой
записью.
16. Возможность открыть dbi-таблицу, одновременно с установкой
компараторов для ключей и данных, посредством `mdbx_dbi_open_ex()`.
17. Возможность посредством `mdbx_is_dirty()` определить находятся ли
некоторый ключ или данные в "грязной" странице БД. Таким образом,
избегая лишнего копирования данных перед выполнением модифицирующих
операций (значения, размещенные в "грязных" страницах, могут быть
перезаписаны при изменениях, иначе они будут неизменны).
18. Корректное обновление текущей записи, в том числе сортированного
дубликата, при использовании режима `MDBX_CURRENT` в
`mdbx_cursor_put()`.
19. Возможность узнать есть ли за текущей позицией курсора строка данных
посредством `mdbx_cursor_eof()`.
20. Дополнительный код ошибки `MDBX_EMULTIVAL`, который возвращается из
`mdbx_put()` и `mdbx_replace()` при попытке выполнить неоднозначное
обновление или удаления одного из нескольких значений с одним ключом.
21. Возможность посредством `mdbx_get_ex()` получить значение по
заданному ключу, одновременно с количеством дубликатов.
22. Наличие функций `mdbx_cursor_on_first()` и `mdbx_cursor_on_last()`,
которые позволяют быстро выяснить стоит ли курсор на первой/последней
позиции.
23. Возможность автоматического формирования контрольных точек (сброса
данных на диск) при накоплении заданного объёма изменений,
устанавливаемого функцией `mdbx_env_set_syncbytes()`.
24. Управление отладкой и получение отладочных сообщений посредством
`mdbx_setup_debug()`.
25. Функция `mdbx_env_pgwalk()` для обхода всех страниц БД.
26. Три мета-страницы вместо двух, что позволяет гарантированно
консистентно обновлять слабые контрольные точки фиксации без риска
повредить крайнюю сильную точку фиксации.
27. Гарантия сохранности БД в режиме `WRITEMAP+MAPSYNC`.
> В текущей версии _libmdbx_ вам предоставляется выбор между безопасным
> режимом (по умолчанию) асинхронной фиксации, и режимом `UTTERLY_NOSYNC`
> когда при системной аварии есть шанс полного разрушения БД как в LMDB.
> Для подробностей смотрите раздел
> [Сохранность данных в режиме асинхронной фиксации](#Сохранность-данных-в-режиме-асинхронной-фиксации).
28. Возможность закрыть БД в "грязном" состоянии (без сброса данных и
формирования сильной точки фиксации) посредством `mdbx_env_close_ex()`.
29. При завершении читающих транзакций, открытые в них DBI-хендлы не
закрываются и не теряются при завершении таких транзакций посредством
`mdbx_txn_abort()` или `mdbx_txn_reset()`. Что позволяет избавится от ряда
сложно обнаруживаемых ошибок.
30. Все курсоры, как в транзакциях только для чтения, так и в пишущих,
могут быть переиспользованы посредством `mdbx_cursor_renew()` и ДОЛЖНЫ
ОСВОБОЖДАТЬСЯ ЯВНО.
>
> ## _ВАЖНО_, Обратите внимание!
>
> Это единственное изменение в API, которое значимо меняет
> семантику управления курсорами и может приводить к утечкам
> памяти. Следует отметить, что это изменение вынужденно.
> Так устраняется неоднозначность с массой тяжких последствий:
>
> - обращение к уже освобожденной памяти;
> - попытки повторного освобождения памяти;
> - повреждение памяти и ошибки сегментации.
--------------------------------------------------------------------------------
## Недостатки и Компромиссы
1. Единовременно может выполняться не более одной транзакция изменения данных
(один писатель). Зато все изменения всегда последовательны, не может быть
конфликтов или логических ошибок при откате транзакций.
2. Отсутствие [WAL](https://en.wikipedia.org/wiki/Write-ahead_logging)
обуславливает относительно большой
[WAF](https://en.wikipedia.org/wiki/Write_amplification) (Write
Amplification Factor) и RAF (Read Amplification Factor) также Olog(N).
Amplification Factor). Поэтому фиксация изменений на диске может быть
достаточно дорогой и являться главным ограничением производительности
при интенсивном изменении данных.
> В качестве компромисса _libmdbx_ предлагает несколько режимов ленивой
> и/или периодической фиксации. В том числе режим `MAPASYNC`, при котором
> изменения происходят только в памяти и асинхронно фиксируются на диске
> ядром ОС.
>
> Однако, следует воспринимать это свойство аккуратно и взвешенно.
> Например, полная фиксация транзакции в БД с журналом потребует минимум 2
> IOPS (скорее всего 3-4) из-за накладных расходов в файловой системе. В
> _libmdbx_ фиксация транзакции также требует от 2 IOPS. Однако, в БД с
> журналом кол-во IOPS будет меняться в зависимости от файловой системы,
> но не от кол-ва записей или их объема. Тогда как в _libmdbx_ кол-во
> будет расти логарифмически от кол-ва записей/строк в БД (по высоте
> b+tree).
8. Нет [WAL](https://en.wikipedia.org/wiki/Write-ahead_logging) и журнала
транзакций, после сбоев не требуется восстановление. Не требуется компактификация
или какое-либо периодическое обслуживание. Поддерживается резервное копирование
"по горячему", на работающей БД без приостановки изменения данных.
3. [COW](https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%9A%D0%BE%D0%BF%D0%B8%D1%80%D0%BE%D0%B2%D0%B0%D0%BD%D0%B8%D0%B5_%D0%BF%D1%80%D0%B8_%D0%B7%D0%B0%D0%BF%D0%B8%D1%81%D0%B8)
для реализации [MVCC](https://ru.wikipedia.org/wiki/MVCC) выполняется на
уровне страниц в [B+
дереве](https://ru.wikipedia.org/wiki/B-%D0%B4%D0%B5%D1%80%D0%B5%D0%B2%D0%BE).
Поэтому изменение данных амортизационно требует копирования Olog(N)
страниц, что расходует [пропускную способность оперативной
памяти](https://en.wikipedia.org/wiki/Memory_bandwidth) и является
основным ограничителем производительности в режиме `MAPASYNC`.
> Этот недостаток неустраним, тем не менее следует дать некоторые пояснения.
> Дело в том, что фиксация изменений на диске потребует гораздо более
> значительного копирования данных в памяти и массы других затратных операций.
> Поэтому обусловленное этим недостатком падение производительности становится
> заметным только при отказе от фиксации изменений на диске.
> Соответственно, корректнее сказать, что _libmdbx_ позволяет
> получить персистентность ценой минимального падения производительности.
> Если же нет необходимости оперативно сохранять данные, то логичнее
> использовать `std::map`.
9. Отсутствует какое-либо внутреннее управление памятью или кэшированием. Всё
необходимое штатно выполняет ядро ОС!
4. В _LMDB_ существует проблема долгих чтений (приостановленных читателей),
которая приводит к деградации производительности и переполнению БД.
> В _libmdbx_ предложены средства для предотвращения, быстрого выхода из
> некомфортной ситуации и устранения её последствий. Подробности ниже.
5. В _LMDB_ есть вероятность разрушения БД в режиме `WRITEMAP+MAPASYNC`.
В _libmdbx_ для `WRITEMAP+MAPASYNC` гарантируется как сохранность базы,
так и согласованность данных.
> Дополнительно, в качестве альтернативы, предложен режим `UTTERLY_NOSYNC`.
> Подробности ниже.
#### Проблема долгих чтений
*Следует отметить*, что проблема "сборки мусора" так или иначе
существует во всех СУБД (Vacuum в PostgreSQL). Однако в случае _libmdbx_
и LMDB она проявляется более остро, прежде всего из-за высокой
производительности, а также из-за намеренного упрощения внутренних
механизмов ради производительности.
Понимание проблемы требует некоторых пояснений, которые
изложены ниже, но могут быть сложны для быстрого восприятия.
Поэтому, тезисно:
* Изменение данных на фоне долгой операции чтения может
приводить к исчерпанию места в БД.
* После чего любая попытка обновить данные будет приводить к
ошибке `MAP_FULL` до завершения долгой операции чтения.
* Характерными примерами долгих чтений являются горячее
резервное копирования и отладка клиентского приложения при
активной транзакции чтения.
* В оригинальной _LMDB_ после этого будет наблюдаться
устойчивая деградация производительности всех механизмов
обратной записи на диск (в I/O контроллере, в гипервизоре,
в ядре ОС).
* В _libmdbx_ предусмотрен механизм аварийного прерывания таких
операций, а также режим `LIFO RECLAIM` устраняющий последующую
деградацию производительности.
Операции чтения выполняются в контексте снимка данных (версии
БД), который был актуальным на момент старта транзакции чтения. Такой
читаемый снимок поддерживается неизменным до завершения операции. В свою
очередь, это не позволяет повторно использовать страницы БД в
последующих версиях (снимках БД).
Другими словами, если обновление данных выполняется на фоне долгой
операции чтения, то вместо повторного использования "старых" ненужных
страниц будут выделяться новые, так как "старые" страницы составляют
снимок БД, который еще используется долгой операцией чтения.
В результате, при интенсивном изменении данных и достаточно длительной
операции чтения, в БД могут быть исчерпаны свободные страницы, что не
позволит создавать новые снимки/версии БД. Такая ситуация будет
сохраняться до завершения операции чтения, которая использует старый
снимок данных и препятствует повторному использованию страниц БД.
Однако, на этом проблемы не заканчиваются. После описанной ситуации, все
дополнительные страницы, которые были выделены пока переработка старых
была невозможна, будут участвовать в цикле выделения/освобождения до
конца жизни экземпляра БД. В оригинальной _LMDB_ этот цикл использования
страниц работает по принципу [FIFO](https://ru.wikipedia.org/wiki/FIFO).
Поэтому увеличение количества циркулирующий страниц, с точки зрения
механизмов кэширования и/или обратной записи, выглядит как увеличение
рабочего набор данных. Проще говоря, однократное попадание в ситуацию
"уснувшего читателя" приводит к устойчивому эффекту вымывания I/O кэша
при всех последующих изменениях данных.
Для устранения описанных проблемы в _libmdbx_ сделаны существенные
доработки, подробности ниже. Иллюстрации к проблеме "долгих чтений"
можно найти в [слайдах презентации](http://www.slideshare.net/leoyuriev/lmdb).
Там же приведен пример количественной оценки прироста производительности
за счет эффективной работы [BBWC](https://en.wikipedia.org/wiki/BBWC)
при включении `LIFO RECLAIM` в _libmdbx_.
#### Сохранность данных в режиме асинхронной фиксации
При работе в режиме `WRITEMAP+MAPSYNC` запись измененных страниц
выполняется ядром ОС, что имеет ряд преимуществ. Так например, при крахе
приложения, ядро ОС сохранит все изменения.
Однако, при аварийном отключении питания или сбое в ядре ОС, на диске
может быть сохранена только часть измененных страниц БД. При этом с
большой вероятностью может оказаться, что будут сохранены мета-страницы
со ссылками на страницы с новыми версиями данных, но не сами новые
данные. В этом случае БД будет безвозвратна разрушена, даже если до
аварии производилась полная синхронизация данных (посредством
`mdbx_env_sync()`).
В _libmdbx_ эта проблема устранена путем полной переработки
пути записи данных:
* В режиме `WRITEMAP+MAPSYNC` _libmdbx_ не обновляет
мета-страницы непосредственно, а поддерживает их теневые копии
с переносом изменений после фиксации данных.
* При завершении транзакций, в зависимости от состояния
синхронности данных между диском и оперативной памятью,
_libmdbx_ помечает точки фиксации либо как сильные (strong),
либо как слабые (weak). Так например, в режиме
`WRITEMAP+MAPSYNC` завершаемые транзакции помечаются как
слабые, а при явной синхронизации данных - как сильные.
* В _libmdbx_ поддерживается не две, а три отдельные мета-страницы.
Это позволяет выполнять фиксацию транзакций с формированием как
сильной, так и слабой точки фиксации, без потери двух предыдущих
точек фиксации (из которых одна может быть сильной, а вторая слабой).
В результате, _libmdbx_ позволяет в произвольном порядке чередовать
сильные и слабые точки фиксации без нарушения соответствующих
гарантий в случае неожиданной системной аварии во время фиксации.
* При открытии БД выполняется автоматический откат к последней
сильной фиксации. Этим обеспечивается гарантия сохранности БД.
Такая гарантия надежности не дается бесплатно. Для сохранности данных,
страницы, формирующие крайний снимок с сильной фиксацией, не должны
повторно использоваться (перезаписываться) до формирования следующей
сильной точки фиксации. Таким образом, крайняя точка фиксации создает
описанный выше эффект "долгого чтения". Разница же здесь в том, что при
исчерпании свободных страниц ситуация будет автоматически исправлена,
посредством записи изменений на диск и формирования новой сильной точки
фиксации.
Таким образом, в режиме безопасной асинхронной фиксации _libmdbx_ будет
всегда использовать новые страницы до исчерпания места в БД или до
явного формирования сильной точки фиксации посредством
`mdbx_env_sync()`. При этом суммарный трафик записи на диск будет
примерно такой же, как если бы отдельно фиксировалась каждая транзакция.
В текущей версии _libmdbx_ вам предоставляется выбор между безопасным
режимом (по умолчанию) асинхронной фиксации, и режимом `UTTERLY_NOSYNC`
когда при системной аварии есть шанс полного разрушения БД как в LMDB.
В последующих версиях _libmdbx_ будут предусмотрены средства для
асинхронной записи данных на диск с автоматическим формированием сильных
точек фиксации.
--------------------------------------------------------------------------------
Сравнение производительности
============================
@ -302,14 +652,15 @@ _libmdbx_ при этом не ведет WAL, а передает весь ко
Показана соотнесенная сумма использованных ресурсов в ходе бенчмарка в
режиме отложенной фиксации:
- суммарное количество операций ввода-вывода (IOPS), как записи, так и
чтения.
- суммарное количество операций ввода-вывода (IOPS), как записи, так и
чтения.
- суммарное затраченное время процессора, как в режиме пользовательских процессов,
так и в режиме ядра ОС.
- суммарное затраченное время процессора, как в режиме пользовательских
процессов, так и в режиме ядра ОС.
- использованное место на диске при завершении теста, после закрытия БД из тестирующего процесса,
но без ожидания всех внутренних операций обслуживания (компактификации LSM и т.п.).
- использованное место на диске при завершении теста, после закрытия БД
из тестирующего процесса, но без ожидания всех внутренних операций
обслуживания (компактификации LSM и т.п.).
Движок _ForestDB_ был исключен при оформлении результатов, так как
относительно конкурентов многократно превысил потребление каждого из
@ -325,352 +676,6 @@ _libmdbx_ при этом не ведет WAL, а передает весь ко
--------------------------------------------------------------------------------
## Недостатки и Компромиссы
1. Единовременно может выполняться не более одной транзакция изменения данных
(один писатель). Зато все изменения всегда последовательны, не может быть
конфликтов или логических ошибок при откате транзакций.
2. Отсутствие [WAL](https://en.wikipedia.org/wiki/Write-ahead_logging)
обуславливает относительно большой
[WAF](https://en.wikipedia.org/wiki/Write_amplification) (Write
Amplification Factor). Поэтому фиксация изменений на диске может быть
достаточно дорогой и являться главным ограничением производительности
при интенсивном изменении данных.
> В качестве компромисса _libmdbx_ предлагает несколько режимов ленивой
> и/или периодической фиксации. В том числе режим `MAPASYNC`, при котором
> изменения происходят только в памяти и асинхронно фиксируются на диске
> ядром ОС.
>
> Однако, следует воспринимать это свойство аккуратно и взвешенно.
> Например, полная фиксация транзакции в БД с журналом потребует минимум 2
> IOPS (скорее всего 3-4) из-за накладных расходов в файловой системе. В
> _libmdbx_ фиксация транзакции также требует от 2 IOPS. Однако, в БД с
> журналом кол-во IOPS будет меняться в зависимости от файловой системы,
> но не от кол-ва записей или их объема. Тогда как в _libmdbx_ кол-во
> будет расти логарифмически от кол-ва записей/строк в БД (по высоте
> b+tree).
3. [COW](https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%9A%D0%BE%D0%BF%D0%B8%D1%80%D0%BE%D0%B2%D0%B0%D0%BD%D0%B8%D0%B5_%D0%BF%D1%80%D0%B8_%D0%B7%D0%B0%D0%BF%D0%B8%D1%81%D0%B8)
для реализации [MVCC](https://ru.wikipedia.org/wiki/MVCC) выполняется на
уровне страниц в [B+
дереве](https://ru.wikipedia.org/wiki/B-%D0%B4%D0%B5%D1%80%D0%B5%D0%B2%D0%BE).
Поэтому изменение данных амортизационно требует копирования Olog(N)
страниц, что расходует [пропускную способность оперативной
памяти](https://en.wikipedia.org/wiki/Memory_bandwidth) и является
основным ограничителем производительности в режиме `MAPASYNC`.
> Этот недостаток неустраним, тем не менее следует дать некоторые пояснения.
> Дело в том, что фиксация изменений на диске потребует гораздо более
> значительного копирования данных в памяти и массы других затратных операций.
> Поэтому обусловленное этим недостатком падение производительности становится
> заметным только при отказе от фиксации изменений на диске.
> Соответственно, корректнее сказать, что _libmdbx_ позволяет
> получить персистентность ценой минимального падения производительности.
> Если же нет необходимости оперативно сохранять данные, то логичнее
> использовать `std::map`.
4. В _LMDB_ существует проблема долгих чтений (приостановленных читателей),
которая приводит к деградации производительности и переполнению БД.
> В _libmdbx_ предложены средства для предотвращения, быстрого выхода из
> некомфортной ситуации и устранения её последствий. Подробности ниже.
5. В _LMDB_ есть вероятность разрушения БД в режиме `WRITEMAP+MAPASYNC`.
В _libmdbx_ для `WRITEMAP+MAPASYNC` гарантируется как сохранность базы,
так и согласованность данных.
> Дополнительно, в качестве альтернативы, предложен режим `UTTERLY_NOSYNC`.
> Подробности ниже.
#### Проблема долгих чтений
*Следует отметить*, что проблема "сборки мусора" так или иначе
существует во всех СУБД (Vacuum в PostgreSQL). Однако в случае _libmdbx_
и LMDB она проявляется более остро, прежде всего из-за высокой
производительности, а также из-за намеренного упрощения внутренних
механизмов ради производительности.
Понимание проблемы требует некоторых пояснений, которые
изложены ниже, но могут быть сложны для быстрого восприятия.
Поэтому, тезисно:
* Изменение данных на фоне долгой операции чтения может
приводить к исчерпанию места в БД.
* После чего любая попытка обновить данные будет приводить к
ошибке `MAP_FULL` до завершения долгой операции чтения.
* Характерными примерами долгих чтений являются горячее
резервное копирования и отладка клиентского приложения при
активной транзакции чтения.
* В оригинальной _LMDB_ после этого будет наблюдаться
устойчивая деградация производительности всех механизмов
обратной записи на диск (в I/O контроллере, в гипервизоре,
в ядре ОС).
* В _libmdbx_ предусмотрен механизм аварийного прерывания таких
операций, а также режим `LIFO RECLAIM` устраняющий последующую
деградацию производительности.
Операции чтения выполняются в контексте снимка данных (версии
БД), который был актуальным на момент старта транзакции чтения. Такой
читаемый снимок поддерживается неизменным до завершения операции. В свою
очередь, это не позволяет повторно использовать страницы БД в
последующих версиях (снимках БД).
Другими словами, если обновление данных выполняется на фоне долгой
операции чтения, то вместо повторного использования "старых" ненужных
страниц будут выделяться новые, так как "старые" страницы составляют
снимок БД, который еще используется долгой операцией чтения.
В результате, при интенсивном изменении данных и достаточно длительной
операции чтения, в БД могут быть исчерпаны свободные страницы, что не
позволит создавать новые снимки/версии БД. Такая ситуация будет
сохраняться до завершения операции чтения, которая использует старый
снимок данных и препятствует повторному использованию страниц БД.
Однако, на этом проблемы не заканчиваются. После описанной ситуации, все
дополнительные страницы, которые были выделены пока переработка старых
была невозможна, будут участвовать в цикле выделения/освобождения до
конца жизни экземпляра БД. В оригинальной _LMDB_ этот цикл использования
страниц работает по принципу [FIFO](https://ru.wikipedia.org/wiki/FIFO).
Поэтому увеличение количества циркулирующий страниц, с точки зрения
механизмов кэширования и/или обратной записи, выглядит как увеличение
рабочего набор данных. Проще говоря, однократное попадание в ситуацию
"уснувшего читателя" приводит к устойчивому эффекту вымывания I/O кэша
при всех последующих изменениях данных.
Для устранения описанных проблемы в _libmdbx_ сделаны существенные
доработки, подробности ниже. Иллюстрации к проблеме "долгих чтений"
можно найти в [слайдах презентации](http://www.slideshare.net/leoyuriev/lmdb).
Там же приведен пример количественной оценки прироста производительности
за счет эффективной работы [BBWC](https://en.wikipedia.org/wiki/BBWC)
при включении `LIFO RECLAIM` в _libmdbx_.
#### Сохранность данных в режиме асинхронной фиксации
При работе в режиме `WRITEMAP+MAPSYNC` запись измененных страниц
выполняется ядром ОС, что имеет ряд преимуществ. Так например, при крахе
приложения, ядро ОС сохранит все изменения.
Однако, при аварийном отключении питания или сбое в ядре ОС, на диске
может быть сохранена только часть измененных страниц БД. При этом с большой
вероятностью может оказаться, что будут сохранены мета-страницы со
ссылками на страницы с новыми версиями данных, но не сами новые данные.
В этом случае БД будет безвозвратна разрушена, даже если до аварии
производилась полная синхронизация данных (посредством
`mdbx_env_sync()`).
В _libmdbx_ эта проблема устранена путем полной переработки
пути записи данных:
* В режиме `WRITEMAP+MAPSYNC` _libmdbx_ не обновляет
мета-страницы непосредственно, а поддерживает их теневые копии
с переносом изменений после фиксации данных.
* При завершении транзакций, в зависимости от состояния
синхронности данных между диском и оперативной памятью,
_libmdbx_ помечает точки фиксации либо как сильные (strong),
либо как слабые (weak). Так например, в режиме
`WRITEMAP+MAPSYNC` завершаемые транзакции помечаются как
слабые, а при явной синхронизации данных - как сильные.
* В _libmdbx_ поддерживается не две, а три отдельные мета-страницы.
Это позволяет выполнять фиксацию транзакций с формированием как
сильной, так и слабой точки фиксации, без потери двух предыдущих
точек фиксации (из которых одна может быть сильной, а вторая слабой).
В результате, _libmdbx_ позволяет в произвольном порядке чередовать
сильные и слабые точки фиксации без нарушения соответствующих
гарантий в случае неожиданной системной аварии во время фиксации.
* При открытии БД выполняется автоматический откат к последней
сильной фиксации. Этим обеспечивается гарантия сохранности БД.
Такая гарантия надежности не дается бесплатно. Для
сохранности данных, страницы, формирующие крайний снимок с
сильной фиксацией, не должны повторно использоваться
(перезаписываться) до формирования следующей сильной точки
фиксации. Таким образом, крайняя точка фиксации создает
описанный выше эффект "долгого чтения". Разница же здесь в том,
что при исчерпании свободных страниц ситуация будет
автоматически исправлена, посредством записи изменений на диск
и формирования новой сильной точки фиксации.
Таким образом, в режиме безопасной асинхронной фиксации _libmdbx_ будет
всегда использовать новые страницы до исчерпания места в БД или до явного
формирования сильной точки фиксации посредством `mdbx_env_sync()`.
При этом суммарный трафик записи на диск будет примерно такой же,
как если бы отдельно фиксировалась каждая транзакция.
В текущей версии _libmdbx_ вам предоставляется выбор между безопасным
режимом (по умолчанию) асинхронной фиксации, и режимом `UTTERLY_NOSYNC` когда
при системной аварии есть шанс полного разрушения БД как в LMDB.
В последующих версиях _libmdbx_ будут предусмотрены средства
для асинхронной записи данных на диск с автоматическим
формированием сильных точек фиксации.
--------------------------------------------------------------------------------
Доработки и усовершенствования относительно LMDB
================================================
1. Режим `LIFO RECLAIM`.
Для повторного использования выбираются не самые старые, а
самые новые страницы из доступных. За счет этого цикл
использования страниц всегда имеет минимальную длину и не
зависит от общего числа выделенных страниц.
В результате механизмы кэширования и обратной записи работают с
максимально возможной эффективностью. В случае использования
контроллера дисков или системы хранения с
[BBWC](https://en.wikipedia.org/wiki/BBWC) возможно
многократное увеличение производительности по записи
(обновлению данных).
2. Обработчик `OOM-KICK`.
Посредством `mdbx_env_set_oomfunc()` может быть установлен
внешний обработчик (callback), который будет вызван при
исчерпании свободных страниц из-за долгой операцией чтения.
Обработчику будет передан PID и pthread_id виновника.
В свою очередь обработчик может предпринять одно из действий:
* нейтрализовать виновника (отправить сигнал kill #9), если
долгое чтение выполняется сторонним процессом;
* отменить или перезапустить проблемную операцию чтения, если
операция выполняется одним из потоков текущего процесса;
* подождать некоторое время, в расчете на то, что проблемная операция
чтения будет штатно завершена;
* прервать текущую операцию изменения данных с возвратом кода
ошибки.
3. Гарантия сохранности БД в режиме `WRITEMAP+MAPSYNC`.
> В текущей версии _libmdbx_ вам предоставляется выбор между безопасным
> режимом (по умолчанию) асинхронной фиксации, и режимом `UTTERLY_NOSYNC`
> когда при системной аварии есть шанс полного разрушения БД как в LMDB.
> Для подробностей смотрите раздел
> [Сохранность данных в режиме асинхронной фиксации](#Сохранность-данных-в-режиме-асинхронной-фиксации).
4. Возможность автоматического формирования контрольных точек
(сброса данных на диск) при накоплении заданного объёма изменений,
устанавливаемого функцией `mdbx_env_set_syncbytes()`.
5. Возможность получить отставание текущей транзакции чтения от
последней версии данных в БД посредством `mdbx_txn_straggler()`.
6. Утилита mdbx_chk для проверки БД и функция `mdbx_env_pgwalk()` для
обхода всех страниц БД.
7. Управление отладкой и получение отладочных сообщений посредством
`mdbx_setup_debug()`.
8. Возможность связать с каждой завершаемой транзакцией до 3
дополнительных маркеров посредством `mdbx_canary_put()`, и прочитать их
в транзакции чтения посредством `mdbx_canary_get()`.
9. Возможность узнать есть ли за текущей позицией курсора строка данных
посредством `mdbx_cursor_eof()`.
10. Возможность явно запросить обновление существующей записи, без
создания новой посредством флажка `MDBX_CURRENT` для `mdbx_put()`.
11. Возможность посредством `mdbx_replace()` обновить или удалить запись
с получением предыдущего значения данных, а также адресно изменить
конкретное multi-значение.
12. Поддержка ключей и значений нулевой длины, включая сортированные
дубликаты.
13. Исправленный вариант `mdbx_cursor_count()`, возвращающий корректное
количество дубликатов для всех типов таблиц и любого положения курсора.
14. Возможность открыть БД в эксклюзивном режиме посредством флага
`MDBX_EXCLUSIVE`, например в целях её проверки.
15. Возможность закрыть БД в "грязном" состоянии (без сброса данных и
формирования сильной точки фиксации) посредством `mdbx_env_close_ex()`.
16. Возможность получить посредством `mdbx_env_info()` дополнительную
информацию, включая номер самой старой версии БД (снимка данных),
который используется одним из читателей.
17. Функция `mdbx_del()` не игнорирует дополнительный (уточняющий)
аргумент `data` для таблиц без дубликатов (без флажка `MDBX_DUPSORT`), а
при его ненулевом значении всегда использует его для сверки с удаляемой
записью.
18. Возможность открыть dbi-таблицу, одновременно с установкой
компараторов для ключей и данных, посредством `mdbx_dbi_open_ex()`.
19. Возможность посредством `mdbx_is_dirty()` определить находятся ли
некоторый ключ или данные в "грязной" странице БД. Таким образом,
избегая лишнего копирования данных перед выполнением модифицирующих
операций (значения, размещенные в "грязных" страницах, могут быть
перезаписаны при изменениях, иначе они будут неизменны).
20. Корректное обновление текущей записи, в том числе сортированного
дубликата, при использовании режима `MDBX_CURRENT` в
`mdbx_cursor_put()`.
21. Все курсоры, как в транзакциях только для чтения, так и в пишущих,
могут быть переиспользованы посредством `mdbx_cursor_renew()` и ДОЛЖНЫ
ОСВОБОЖДАТЬСЯ ЯВНО.
>
> ## _ВАЖНО_, Обратите внимание!
>
> Это единственное изменение в API, которое значимо меняет
> семантику управления курсорами и может приводить к утечкам
> памяти. Следует отметить, что это изменение вынужденно.
> Так устраняется неоднозначность с массой тяжких последствий:
>
> - обращение к уже освобожденной памяти;
> - попытки повторного освобождения памяти;
> - повреждение памяти и ошибки сегментации.
22. Дополнительный код ошибки `MDBX_EMULTIVAL`, который возвращается из
`mdbx_put()` и `mdbx_replace()` при попытке выполнить неоднозначное
обновление или удаления одного из нескольких значений с одним ключом.
23. Возможность посредством `mdbx_get_ex()` получить значение по
заданному ключу, одновременно с количеством дубликатов.
24. Наличие функций `mdbx_cursor_on_first()` и `mdbx_cursor_on_last()`,
которые позволяют быстро выяснить стоит ли курсор на первой/последней
позиции.
25. При завершении читающих транзакций, открытые в них DBI-хендлы не
закрываются и не теряются при завершении таких транзакций посредством
`mdbx_txn_abort()` или `mdbx_txn_reset()`. Что позволяет избавится от ряда
сложно обнаруживаемых ошибок.
26. Генерация последовательностей посредством `mdbx_dbi_sequence()`.
27. Расширенное динамическое управление размером БД, включая выбор
размера страницы посредством `mdbx_env_set_geometry()`,
в том числе в **Windows**
28. Три мета-страницы вместо двух, что позволяет гарантированно
консистентно обновлять слабые контрольные точки фиксации без риска
повредить крайнюю сильную точку фиксации.
29. В _libmdbx_ реализован автоматический возврат освобождающихся
страниц в область нераспределенного резерва в конце файла данных. При
этом уменьшается количество страниц загруженных в память и участвующих в
цикле обновления данных и записи на диск. Фактически _libmdbx_ выполняет
постоянную компактификацию данных, но не затрачивая на это
дополнительных ресурсов, а только освобождая их. При освобождении места
в БД и установке соответствующих параметров геометрии базы данных, также будет
уменьшаться размер файла на диске, в том числе в **Windows**.
--------------------------------------------------------------------------------
```
$ objdump -f -h -j .text libmdbx.so
@ -685,16 +690,3 @@ Idx Name Size VMA LMA File off Algn
CONTENTS, ALLOC, LOAD, READONLY, CODE
```
```
$ gcc -v
Using built-in specs.
COLLECT_GCC=gcc
COLLECT_LTO_WRAPPER=/usr/lib/gcc/x86_64-linux-gnu/7/lto-wrapper
OFFLOAD_TARGET_NAMES=nvptx-none
OFFLOAD_TARGET_DEFAULT=1
Target: x86_64-linux-gnu
Configured with: ../src/configure -v --with-pkgversion='Ubuntu 7.2.0-8ubuntu3' --with-bugurl=file:///usr/share/doc/gcc-7/README.Bugs --enable-languages=c,ada,c++,go,brig,d,fortran,objc,obj-c++ --prefix=/usr --with-gcc-major-version-only --program-suffix=-7 --program-prefix=x86_64-linux-gnu- --enable-shared --enable-linker-build-id --libexecdir=/usr/lib --without-included-gettext --enable-threads=posix --libdir=/usr/lib --enable-nls --with-sysroot=/ --enable-clocale=gnu --enable-libstdcxx-debug --enable-libstdcxx-time=yes --with-default-libstdcxx-abi=new --enable-gnu-unique-object --disable-vtable-verify --enable-libmpx --enable-plugin --enable-default-pie --with-system-zlib --with-target-system-zlib --enable-objc-gc=auto --enable-multiarch --disable-werror --with-arch-32=i686 --with-abi=m64 --with-multilib-list=m32,m64,mx32 --enable-multilib --with-tune=generic --enable-offload-targets=nvptx-none --without-cuda-driver --enable-checking=release --build=x86_64-linux-gnu --host=x86_64-linux-gnu --target=x86_64-linux-gnu
Thread model: posix
gcc version 7.2.0 (Ubuntu 7.2.0-8ubuntu3)
```

758
README.md
View File

@ -9,9 +9,21 @@ libmdbx
## Project Status for now
- The stable versions ([_stable/0.0_](https://github.com/leo-yuriev/libmdbx/tree/stable/0.0) and [_stable/0.1_](https://github.com/leo-yuriev/libmdbx/tree/stable/0.1) branches) of _MDBX_ are frozen, i.e. no new features or API changes, but only bug fixes.
- The next version ([_devel_](https://github.com/leo-yuriev/libmdbx/tree/devel) branch) **is under active non-public development**, i.e. current API and set of features are extreme volatile.
- The immediate goal of development is formation of the stable API and the stable internal database format, which allows realise all PLANNED FEATURES:
- The stable versions
([_stable/0.0_](https://github.com/leo-yuriev/libmdbx/tree/stable/0.0)
and
[_stable/0.1_](https://github.com/leo-yuriev/libmdbx/tree/stable/0.1)
branches) of _MDBX_ are frozen, i.e. no new features or API changes, but
only bug fixes.
- The next version
([_devel_](https://github.com/leo-yuriev/libmdbx/tree/devel) branch)
**is under active non-public development**, i.e. current API and set of
features are extreme volatile.
- The immediate goal of development is formation of the stable API and
the stable internal database format, which allows realise all PLANNED
FEATURES:
1. Integrity check by [Merkle tree](https://en.wikipedia.org/wiki/Merkle_tree);
2. Support for [raw block devices](https://en.wikipedia.org/wiki/Raw_device);
3. Separate place (HDD) for large data items;
@ -24,19 +36,21 @@ Don't miss [Java Native Interface](https://github.com/castortech/mdbxjni) by [Ca
-----
Nowadays MDBX intended for Linux, and support Windows (since
Windows Server 2008) as a complementary platform. Support for
other OS could be implemented on commercial basis. However such
enhancements (i.e. pull requests) could be accepted in
mainstream only when corresponding public and free Continuous
Integration service will be available.
Nowadays MDBX intended for Linux, and support Windows (since Windows
Server 2008) as a complementary platform. Support for other OS could be
implemented on commercial basis. However such enhancements (i.e. pull
requests) could be accepted in mainstream only when corresponding public
and free Continuous Integration service will be available.
## Contents
- [Overview](#overview)
- [Comparison with other DBs](#comparison-with-other-dbs)
- [History & Acknowledgments](#history)
- [Main features](#main-features)
- [Improvements over LMDB](#improvements-over-lmdb)
- [Gotchas](#gotchas)
- [Long-time read transactions problem](#long-time-read-transactions-problem)
- [Data safety in async-write-mode](#data-safety-in-async-write-mode)
- [Performance comparison](#performance-comparison)
- [Integral performance](#integral-performance)
- [Read scalability](#read-scalability)
@ -44,52 +58,58 @@ Integration service will be available.
- [Lazy-write mode](#lazy-write-mode)
- [Async-write mode](#async-write-mode)
- [Cost comparison](#cost-comparison)
- [Gotchas](#gotchas)
- [Long-time read transactions problem](#long-time-read-transactions-problem)
- [Data safety in async-write-mode](#data-safety-in-async-write-mode)
- [Improvements over LMDB](#improvements-over-lmdb)
## Overview
_libmdbx_ is an embedded lightweight key-value database engine oriented
for performance under Linux and Windows.
_libmdbx_ is an embedded lightweight key-value database engine oriented for performance under Linux and Windows.
_libmdbx_ allows multiple processes to read and update several key-value tables concurrently,
while being [ACID](https://en.wikipedia.org/wiki/ACID)-compliant, with minimal overhead and operation cost of Olog(N).
_libmdbx_ allows multiple processes to read and update several key-value
tables concurrently, while being
[ACID](https://en.wikipedia.org/wiki/ACID)-compliant, with minimal
overhead and operation cost of Olog(N).
_libmdbx_ provides
[serializability](https://en.wikipedia.org/wiki/Serializability) and consistency of data after crash.
Read-write transactions don't block read-only transactions and are
[serialized](https://en.wikipedia.org/wiki/Serializability) by [mutex](https://en.wikipedia.org/wiki/Mutual_exclusion).
[serializability](https://en.wikipedia.org/wiki/Serializability) and
consistency of data after crash. Read-write transactions don't block
read-only transactions and are
[serialized](https://en.wikipedia.org/wiki/Serializability) by
[mutex](https://en.wikipedia.org/wiki/Mutual_exclusion).
_libmdbx_ [wait-free](https://en.wikipedia.org/wiki/Non-blocking_algorithm#Wait-freedom) provides parallel read transactions
without atomic operations or synchronization primitives.
_libmdbx_
[wait-free](https://en.wikipedia.org/wiki/Non-blocking_algorithm#Wait-freedom)
provides parallel read transactions without atomic operations or
synchronization primitives.
_libmdbx_ uses [B+Trees](https://en.wikipedia.org/wiki/B%2B_tree) and [mmap](https://en.wikipedia.org/wiki/Memory-mapped_file),
doesn't use [WAL](https://en.wikipedia.org/wiki/Write-ahead_logging). This might have caveats for some workloads.
_libmdbx_ uses [B+Trees](https://en.wikipedia.org/wiki/B%2B_tree) and
[mmap](https://en.wikipedia.org/wiki/Memory-mapped_file), doesn't use
[WAL](https://en.wikipedia.org/wiki/Write-ahead_logging). This might
have caveats for some workloads.
### Comparison with other DBs
Because _libmdbx_ is currently overhauled, I think it's better to just link
[chapter of Comparison with other databases](https://github.com/coreos/bbolt#comparison-with-other-databases) here.
Because _libmdbx_ is currently overhauled, I think it's better to just
link [chapter of Comparison with other
databases](https://github.com/coreos/bbolt#comparison-with-other-databases)
here.
### History
The _libmdbx_ design is based on [Lightning Memory-Mapped
Database](https://en.wikipedia.org/wiki/Lightning_Memory-Mapped_Database).
Initial development was going in
[ReOpenLDAP](https://github.com/leo-yuriev/ReOpenLDAP) project, about a
year later it received separate development effort and in autumn 2015
was isolated to separate project, which was [presented at Highload++
2015 conference](http://www.highload.ru/2015/abstracts/1831.html).
The _libmdbx_ design is based on [Lightning Memory-Mapped Database](https://en.wikipedia.org/wiki/Lightning_Memory-Mapped_Database).
Initial development was going in [ReOpenLDAP](https://github.com/leo-yuriev/ReOpenLDAP) project, about a year later it
received separate development effort and in autumn 2015 was isolated to separate project, which was
[presented at Highload++ 2015 conference](http://www.highload.ru/2015/abstracts/1831.html).
Since early 2017 _libmdbx_ is used in [Fast Positive Tables](https://github.com/leo-yuriev/libfpta),
Since early 2017 _libmdbx_ is used in [Fast PositiveTables](https://github.com/leo-yuriev/libfpta),
by [Positive Technologies](https://www.ptsecurity.com).
#### Acknowledgments
Howard Chu (Symas Corporation) - the author of LMDB, from which
originated the MDBX in 2015.
Howard Chu (Symas Corporation) - the author of LMDB,
from which originated the MDBX in 2015.
Martin Hedenfalk <martin@bzero.se> - the author of `btree.c` code,
which was used for begin development of LMDB.
Martin Hedenfalk <martin@bzero.se> - the author of `btree.c` code, which
was used for begin development of LMDB.
Main features
@ -98,39 +118,331 @@ Main features
_libmdbx_ inherits all keys features and characteristics from
[LMDB](https://en.wikipedia.org/wiki/Lightning_Memory-Mapped_Database):
1. Data is stored in ordered map, keys are always sorted, range lookups are supported.
1. Data is stored in ordered map, keys are always sorted, range lookups
are supported.
2. Data is [mmaped](https://en.wikipedia.org/wiki/Memory-mapped_file) to memory of each worker DB process, read transactions are zero-copy.
2. Data is [mmaped](https://en.wikipedia.org/wiki/Memory-mapped_file) to
memory of each worker DB process, read transactions are zero-copy.
3. Transactions are [ACID](https://en.wikipedia.org/wiki/ACID)-compliant, thanks to
[MVCC](https://en.wikipedia.org/wiki/Multiversion_concurrency_control) and [CoW](https://en.wikipedia.org/wiki/Copy-on-write).
Writes are strongly serialized and aren't blocked by reads, transactions can't conflict with each other.
Reads are guaranteed to get only commited data
([relaxing serializability](https://en.wikipedia.org/wiki/Serializability#Relaxing_serializability)).
3. Transactions are
[ACID](https://en.wikipedia.org/wiki/ACID)-compliant, thanks to
[MVCC](https://en.wikipedia.org/wiki/Multiversion_concurrency_control)
and [CoW](https://en.wikipedia.org/wiki/Copy-on-write). Writes are
strongly serialized and aren't blocked by reads, transactions can't
conflict with each other. Reads are guaranteed to get only commited data
([relaxing serializability](https://en.wikipedia.org/wiki/Serializability#Relaxing_serializability)).
4. Reads and queries are [non-blocking](https://en.wikipedia.org/wiki/Non-blocking_algorithm),
don't use [atomic operations](https://en.wikipedia.org/wiki/Linearizability#High-level_atomic_operations).
Readers don't block each other and aren't blocked by writers. Read performance scales linearly with CPU core count.
> Though "connect to DB" (start of first read transaction in thread) and "disconnect from DB" (shutdown or thread
> termination) requires to acquire a lock to register/unregister current thread from "readers table"
4. Reads and queries are
[non-blocking](https://en.wikipedia.org/wiki/Non-blocking_algorithm),
don't use [atomic
operations](https://en.wikipedia.org/wiki/Linearizability#High-level_atomic_operations).
Readers don't block each other and aren't blocked by writers. Read
performance scales linearly with CPU core count.
> Though "connect to DB" (start of first read transaction in thread) and
> "disconnect from DB" (shutdown or thread termination) requires to
> acquire a lock to register/unregister current thread from "readers
> table"
5. Keys with multiple values are stored efficiently without key duplication, sorted by value, including integers
(reasonable for secondary indexes).
5. Keys with multiple values are stored efficiently without key
duplication, sorted by value, including integers (reasonable for
secondary indexes).
6. Efficient operation on short fixed length keys, including integer ones.
6. Efficient operation on short fixed length keys, including integer
ones.
7. [WAF](https://en.wikipedia.org/wiki/Write_amplification) (Write Amplification Factor) и RAF (Read Amplification Factor)
are Olog(N).
7. [WAF](https://en.wikipedia.org/wiki/Write_amplification) (Write
Amplification Factor) и RAF (Read Amplification Factor) are Olog(N).
8. No [WAL](https://en.wikipedia.org/wiki/Write-ahead_logging) and transaction journal.
In case of a crash no recovery needed. No need for regular maintenance. Backups can be made on the fly on working DB
without freezing writers.
8. No [WAL](https://en.wikipedia.org/wiki/Write-ahead_logging) and
transaction journal. In case of a crash no recovery needed. No need for
regular maintenance. Backups can be made on the fly on working DB
without freezing writers.
9. No custom memory management, all done with standard OS syscalls.
--------------------------------------------------------------------------------
Improvements over LMDB
======================
1. `mdbx_chk` tool for DB integrity check.
2. Automatic dynamic DB size management according to the parameters
specified by `mdbx_env_set_geometry()` function. Including including
growth step and truncation threshold, as well as the choice of page
size.
3. Automatic returning of freed pages into unallocated space at the end
of database file with optionally automatic shrinking it. This reduces
amount of pages resides in RAM and circulated in disk I/O. In fact
_libmdbx_ constantly performs DB compactification, without spending
additional resources for that.
4. Support for keys and values of zero length, including sorted
duplicates.
5. Ability to assign up to 3 markers to commiting transaction with
`mdbx_canary_put()` and then get them in read transaction by
`mdbx_canary_get()`.
6. Ability to update or delete record and get previous value via
`mdbx_replace()` Also can update specific multi-value.
7. `LIFO RECLAIM` mode:
The newest pages are picked for reuse instead of the oldest. This allows
to minimize reclaim loop and make it execution time independent of total
page count.
This results in OS kernel cache mechanisms working with maximum
efficiency. In case of using disk controllers or storages with
[BBWC](https://en.wikipedia.org/wiki/Disk_buffer#Write_acceleration)
this may greatly improve write performance.
8. Sequence generation via `mdbx_dbi_sequence()`.
9. `OOM-KICK` callback.
`mdbx_env_set_oomfunc()` allows to set a callback, which will be called
in the event of DB space exhausting during long-time read transaction in
parallel with extensive updating. Callback will be invoked with PID and
pthread_id of offending thread as parameters. Callback can do any of
these things to remedy the problem:
* wait for read transaction to finish normally;
* kill the offending process (signal 9), if separate process is doing
long-time read;
* abort or restart offending read transaction if it's running in sibling
thread;
* abort current write transaction with returning error code.
10. Ability to open DB in exclusive mode with `MDBX_EXCLUSIVE` flag.
11. Ability to get how far current read-only snapshot is from latest
version of the DB by `mdbx_txn_straggler()`.
12. Ability to explicitly request update of present record without
creating new record. Implemented as `MDBX_CURRENT` flag for
`mdbx_put()`.
13. Fixed `mdbx_cursor_count()`, which returns correct count of
duplicated for all table types and any cursor position.
14. `mdbx_env_info()` to getting additional info, including number of
the oldest snapshot of DB, which is used by one of the readers.
15. `mdbx_del()` doesn't ignore additional argument (specifier) `data`
for tables without duplicates (without flag `MDBX_DUPSORT`), if `data`
is not null then always uses it to verify record, which is being
deleted.
16. Ability to open dbi-table with simultaneous setup of comparators for
keys and values, via `mdbx_dbi_open_ex()`.
17. `mdbx_is_dirty()`to find out if key or value is on dirty page, that
useful to avoid copy-out before updates.
18. Correct update of current record in `MDBX_CURRENT` mode of
`mdbx_cursor_put()`, including sorted duplicated.
19. Check if there is a row with data after current cursor position via
`mdbx_cursor_eof()`.
20. Additional error code `MDBX_EMULTIVAL`, which is returned by
`mdbx_put()` and `mdbx_replace()` in case is ambiguous update or delete.
21. Ability to get value by key and duplicates count by `mdbx_get_ex()`.
22. Functions `mdbx_cursor_on_first()` and `mdbx_cursor_on_last()`,
which allows to know if cursor is currently on first or last position
respectively.
23. Automatic creation of synchronization points (flush changes to
persistent storage) when changes reach set threshold (threshold can be
set by `mdbx_env_set_syncbytes()`).
24. Control over debugging and receiving of debugging messages via
`mdbx_setup_debug()`.
25. Function `mdbx_env_pgwalk()` for page-walking all pages in DB.
26. Three meta-pages instead of two, this allows to guarantee
consistently update weak sync-points without risking to corrupt last
steady sync-point.
27. Guarantee of DB integrity in `WRITEMAP+MAPSYNC` mode:
> Current _libmdbx_ gives a choice of safe async-write mode (default)
> and `UTTERLY_NOSYNC` mode which may result in full
> DB corruption during system crash as with LMDB. For details see
> [Data safety in async-write mode](#data-safety-in-async-write-mode).
28. Ability to close DB in "dirty" state (without data flush and
creation of steady synchronization point) via `mdbx_env_close_ex()`.
29. If read transaction is aborted via `mdbx_txn_abort()` or
`mdbx_txn_reset()` then DBI-handles, which were opened in it, aren't
closed or deleted. This allows to avoid several types of hard-to-debug
errors.
30. All cursors in all read and write transactions can be reused by
`mdbx_cursor_renew()` and MUST be freed explicitly.
> ## Caution, please pay attention!
>
> This is the only change of API, which changes semantics of cursor management
> and can lead to memory leaks on misuse. This is a needed change as it eliminates ambiguity
> which helps to avoid such errors as:
> - use-after-free;
> - double-free;
> - memory corruption and segfaults.
--------------------------------------------------------------------------------
## Gotchas
1. At one moment there can be only one writer. But this allows to
serialize writes and eliminate any possibility of conflict or logical
errors during transaction rollback.
2. No [WAL](https://en.wikipedia.org/wiki/Write-ahead_logging) means
relatively big [WAF](https://en.wikipedia.org/wiki/Write_amplification)
(Write Amplification Factor). Because of this syncing data to disk might
be quite resource intensive and be main performance bottleneck during
intensive write workload.
> As compromise _libmdbx_ allows several modes of lazy and/or periodic
> syncing, including `MAPASYNC` mode, which modificate data in memory and
> asynchronously syncs data to disk, moment to sync is picked by OS.
>
> Although this should be used with care, synchronous transactions in a DB
> with transaction journal will require 2 IOPS minimum (probably 3-4 in
> practice) because of filesystem overhead, overhead depends on
> filesystem, not on record count or record size. In _libmdbx_ IOPS count
> will grow logarithmically depending on record count in DB (height of B+
> tree) and will require at least 2 IOPS per transaction too.
3. [CoW](https://en.wikipedia.org/wiki/Copy-on-write) for
[MVCC](https://en.wikipedia.org/wiki/Multiversion_concurrency_control)
is done on memory page level with
[B+trees](https://ru.wikipedia.org/wiki/B-%D0%B4%D0%B5%D1%80%D0%B5%D0%B2%D0%BE).
Therefore altering data requires to copy about Olog(N) memory pages,
which uses [memory bandwidth](https://en.wikipedia.org/wiki/Memory_bandwidth) and is main
performance bottleneck in `MAPASYNC` mode.
> This is unavoidable, but isn't that bad. Syncing data to disk requires
> much more similar operations which will be done by OS, therefore this is
> noticeable only if data sync to persistent storage is fully disabled.
> _libmdbx_ allows to safely save data to persistent storage with minimal
> performance overhead. If there is no need to save data to persistent
> storage then it's much more preferable to use `std::map`.
4. LMDB has a problem of long-time readers which degrades performance
and bloats DB.
> _libmdbx_ addresses that, details below.
5. _LMDB_ is susceptible to DB corruption in `WRITEMAP+MAPASYNC` mode.
_libmdbx_ in `WRITEMAP+MAPASYNC` guarantees DB integrity and consistency
of data.
> Additionally there is an alternative: `UTTERLY_NOSYNC` mode.
> Details below.
#### Long-time read transactions problem
Garbage collection problem exists in all databases one way or another
(e.g. VACUUM in PostgreSQL). But in _libmdbx_ and LMDB it's even more
important because of high performance and deliberate simplification of
internals with emphasis on performance.
* Altering data during long read operation may exhaust available space
on persistent storage.
* If available space is exhausted then any attempt to update data
results in `MAP_FULL` error until long read operation ends.
* Main examples of long readers is hot backup and debugging of client
application which actively uses read transactions.
* In _LMDB_ this results in degraded performance of all operations of
syncing data to persistent storage.
* _libmdbx_ has a mechanism which aborts such operations and `LIFO RECLAIM`
mode which addresses performance degradation.
Read operations operate only over snapshot of DB which is consistent on
the moment when read transaction started. This snapshot doesn't change
throughout the transaction but this leads to inability to reclaim the
pages until read transaction ends.
In _LMDB_ this leads to a problem that memory pages, allocated for
operations during long read, will be used for operations and won't be
reclaimed until DB process terminates. In _LMDB_ they are used in
[FIFO](https://en.wikipedia.org/wiki/FIFO_(computing_and_electronics))
manner, which causes increased page count and less chance of cache hit
during I/O. In other words: one long-time reader can impact performance
of all database until it'll be reopened.
_libmdbx_ addresses the problem, details below. Illustrations to this
problem can be found in the
[presentation](http://www.slideshare.net/leoyuriev/lmdb). There is also
example of performance increase thanks to
[BBWC](https://en.wikipedia.org/wiki/Disk_buffer#Write_acceleration)
when `LIFO RECLAIM` enabled in _libmdbx_.
#### Data safety in async-write mode
In `WRITEMAP+MAPSYNC` mode dirty pages are written to persistent storage
by kernel. This means that in case of application crash OS kernel will
write all dirty data to disk and nothing will be lost. But in case of
hardware malfunction or OS kernel fatal error only some dirty data might
be synced to disk, and there is high probability that pages with
metadata saved, will point to non-saved, hence non-existent, data pages.
In such situation, DB is completely corrupted and can't be repaired even
if there was full sync before the crash via `mdbx_env_sync().
_libmdbx_ addresses this by fully reimplementing write path of data:
* In `WRITEMAP+MAPSYNC` mode meta-data pages aren't updated in place,
instead their shadow copies are used and their updates are synced after
data is flushed to disk.
* During transaction commit _libmdbx_ marks synchronization points as
steady or weak depending on how much synchronization needed between RAM
and persistent storage, e.g. in `WRITEMAP+MAPSYNC` commited transactions
are marked as weak, but during explicit data synchronization - as
steady.
* _libmdbx_ maintains three separate meta-pages instead of two. This
allows to commit transaction with steady or weak synchronization point
without losing two previous synchronization points (one of them can be
steady, and second - weak). This allows to order weak and steady
synchronization points in any order without losing consistency in case
of system crash.
* During DB open _libmdbx_ rollbacks to the last steady synchronization
point, this guarantees database integrity.
For data safety pages which form database snapshot with steady
synchronization point must not be updated until next steady
synchronization point. So last steady synchronization point creates
"long-time read" effect. The only difference that in case of memory
exhaustion the problem will be immediately addressed by flushing changes
to persistent storage and forming new steady synchronization point.
So in async-write mode _libmdbx_ will always use new pages until memory
is exhausted or `mdbx_env_sync()` is invoked. Total disk usage will be
almost the same as in sync-write mode.
Current _libmdbx_ gives a choice of safe async-write mode (default) and
`UTTERLY_NOSYNC` mode which may result in full DB corruption during
system crash as with LMDB.
Next version of _libmdbx_ will create steady synchronization points
automatically in async-write mode.
--------------------------------------------------------------------------------
Performance comparison
=====================
======================
All benchmarks were done by [IOArena](https://github.com/pmwkaa/ioarena)
and multiple [scripts](https://github.com/pmwkaa/ioarena/tree/HL%2B%2B2015)
@ -143,18 +455,21 @@ SSD SAMSUNG MZNTD512HAGL-000L1 (DXT23L0Q) 512 Gb.
Here showed sum of performance metrics in 3 benchmarks:
- Read/Search on 4 CPU cores machine;
- Read/Search on 4 CPU cores machine;
- Transactions with [CRUD](https://en.wikipedia.org/wiki/CRUD) operations
in sync-write mode (fdatasync is called after each transaction);
- Transactions with [CRUD](https://en.wikipedia.org/wiki/CRUD)
operations in sync-write mode (fdatasync is called after each
transaction);
- Transactions with [CRUD](https://en.wikipedia.org/wiki/CRUD) operations
in lazy-write mode (moment to sync data to persistent storage is decided by OS).
- Transactions with [CRUD](https://en.wikipedia.org/wiki/CRUD)
operations in lazy-write mode (moment to sync data to persistent storage
is decided by OS).
*Reasons why asynchronous mode isn't benchmarked here:*
1. It doesn't make sense as it has to be done with DB engines, oriented for keeping data in memory e.g.
[Tarantool](https://tarantool.io/), [Redis](https://redis.io/)), etc.
1. It doesn't make sense as it has to be done with DB engines, oriented
for keeping data in memory e.g. [Tarantool](https://tarantool.io/),
[Redis](https://redis.io/)), etc.
2. Performance gap is too high to compare in any meaningful way.
@ -164,7 +479,8 @@ Here showed sum of performance metrics in 3 benchmarks:
### Read Scalability
Summary performance with concurrent read/search queries in 1-2-4-8 threads on 4 CPU cores machine.
Summary performance with concurrent read/search queries in 1-2-4-8
threads on 4 CPU cores machine.
![Comparison #2: Read Scalability](https://raw.githubusercontent.com/wiki/leo-yuriev/libmdbx/img/perf-slide-2.png)
@ -172,15 +488,21 @@ Summary performance with concurrent read/search queries in 1-2-4-8 threads on 4
### Sync-write mode
- Linear scale on left and dark rectangles mean arithmetic mean transactions per second;
- Linear scale on left and dark rectangles mean arithmetic mean
transactions per second;
- Logarithmic scale on right is in seconds and yellow intervals mean execution time of transactions.
Each interval shows minimal and maximum execution time, cross marks standard deviation.
- Logarithmic scale on right is in seconds and yellow intervals mean
execution time of transactions. Each interval shows minimal and maximum
execution time, cross marks standard deviation.
**10,000 transactions in sync-write mode**. In case of a crash all data is consistent and state is right after last successful transaction. [fdatasync](https://linux.die.net/man/2/fdatasync) syscall is used after each write transaction in this mode.
**10,000 transactions in sync-write mode**. In case of a crash all data
is consistent and state is right after last successful transaction.
[fdatasync](https://linux.die.net/man/2/fdatasync) syscall is used after
each write transaction in this mode.
In the benchmark each transaction contains combined CRUD operations (2 inserts, 1 read, 1 update, 1 delete).
Benchmark starts on empty database and after full run the database contains 10,000 small key-value records.
In the benchmark each transaction contains combined CRUD operations (2
inserts, 1 read, 1 update, 1 delete). Benchmark starts on empty database
and after full run the database contains 10,000 small key-value records.
![Comparison #3: Sync-write mode](https://raw.githubusercontent.com/wiki/leo-yuriev/libmdbx/img/perf-slide-3.png)
@ -188,18 +510,25 @@ Benchmark starts on empty database and after full run the database contains 10,0
### Lazy-write mode
- Linear scale on left and dark rectangles mean arithmetic mean of thousands transactions per second;
- Linear scale on left and dark rectangles mean arithmetic mean of
thousands transactions per second;
- Logarithmic scale on right in seconds and yellow intervals mean execution time of transactions. Each interval shows minimal and maximum execution time, cross marks standard deviation.
- Logarithmic scale on right in seconds and yellow intervals mean
execution time of transactions. Each interval shows minimal and maximum
execution time, cross marks standard deviation.
**100,000 transactions in lazy-write mode**.
In case of a crash all data is consistent and state is right after one of last transactions, but transactions after it
will be lost. Other DB engines use [WAL](https://en.wikipedia.org/wiki/Write-ahead_logging) or transaction journal for that,
which in turn depends on order of operations in journaled filesystem. _libmdbx_ doesn't use WAL and hands I/O operations
**100,000 transactions in lazy-write mode**. In case of a crash all data
is consistent and state is right after one of last transactions, but
transactions after it will be lost. Other DB engines use
[WAL](https://en.wikipedia.org/wiki/Write-ahead_logging) or transaction
journal for that, which in turn depends on order of operations in
journaled filesystem. _libmdbx_ doesn't use WAL and hands I/O operations
to filesystem and OS kernel (mmap).
In the benchmark each transaction contains combined CRUD operations (2 inserts, 1 read, 1 update, 1 delete).
Benchmark starts on empty database and after full run the database contains 100,000 small key-value records.
In the benchmark each transaction contains combined CRUD operations (2
inserts, 1 read, 1 update, 1 delete). Benchmark starts on empty database
and after full run the database contains 100,000 small key-value
records.
![Comparison #4: Lazy-write mode](https://raw.githubusercontent.com/wiki/leo-yuriev/libmdbx/img/perf-slide-4.png)
@ -208,14 +537,23 @@ Benchmark starts on empty database and after full run the database contains 100,
### Async-write mode
- Linear scale on left and dark rectangles mean arithmetic mean of thousands transactions per second;
- Linear scale on left and dark rectangles mean arithmetic mean of
thousands transactions per second;
- Logarithmic scale on right in seconds and yellow intervals mean execution time of transactions. Each interval shows minimal and maximum execution time, cross marks standard deviation.
- Logarithmic scale on right in seconds and yellow intervals mean
execution time of transactions. Each interval shows minimal and maximum
execution time, cross marks standard deviation.
**1,000,000 transactions in async-write mode**. In case of a crash all data will be consistent and state will be right after one of last transactions, but lost transaction count is much higher than in lazy-write mode. All DB engines in this mode do as little writes as possible on persistent storage. _libmdbx_ uses [msync(MS_ASYNC)](https://linux.die.net/man/2/msync) in this mode.
**1,000,000 transactions in async-write mode**. In case of a crash all
data will be consistent and state will be right after one of last
transactions, but lost transaction count is much higher than in
lazy-write mode. All DB engines in this mode do as little writes as
possible on persistent storage. _libmdbx_ uses
[msync(MS_ASYNC)](https://linux.die.net/man/2/msync) in this mode.
In the benchmark each transaction contains combined CRUD operations (2 inserts, 1 read, 1 update, 1 delete).
Benchmark starts on empty database and after full run the database contains 10,000 small key-value records.
In the benchmark each transaction contains combined CRUD operations (2
inserts, 1 read, 1 update, 1 delete). Benchmark starts on empty database
and after full run the database contains 10,000 small key-value records.
![Comparison #5: Async-write mode](https://raw.githubusercontent.com/wiki/leo-yuriev/libmdbx/img/perf-slide-5.png)
@ -229,237 +567,22 @@ Summary of used resources during lazy-write mode benchmarks:
- Sum of user CPU time and sys CPU time;
- Used space on persistent storage after the test and closed DB, but not waiting for the end of all internal
housekeeping operations (LSM compactification, etc).
- Used space on persistent storage after the test and closed DB, but not
waiting for the end of all internal housekeeping operations (LSM
compactification, etc).
_ForestDB_ is excluded because benchmark showed it's resource consumption for each resource (CPU, IOPS) much higher than other engines which prevents to meaningfully compare it with them.
_ForestDB_ is excluded because benchmark showed it's resource
consumption for each resource (CPU, IOPS) much higher than other engines
which prevents to meaningfully compare it with them.
All benchmark data is gathered by [getrusage()](http://man7.org/linux/man-pages/man2/getrusage.2.html) syscall and by
scanning data directory.
All benchmark data is gathered by
[getrusage()](http://man7.org/linux/man-pages/man2/getrusage.2.html)
syscall and by scanning data directory.
![Comparison #6: Cost comparison](https://raw.githubusercontent.com/wiki/leo-yuriev/libmdbx/img/perf-slide-6.png)
--------------------------------------------------------------------------------
## Gotchas
1. At one moment there can be only one writer. But this allows to serialize writes and eliminate any possibility
of conflict or logical errors during transaction rollback.
2. No [WAL](https://en.wikipedia.org/wiki/Write-ahead_logging) means relatively
big [WAF](https://en.wikipedia.org/wiki/Write_amplification) (Write Amplification Factor).
Because of this syncing data to disk might be quite resource intensive and be main performance bottleneck
during intensive write workload.
> As compromise _libmdbx_ allows several modes of lazy and/or periodic syncing, including `MAPASYNC` mode, which modificate
> data in memory and asynchronously syncs data to disk, moment to sync is picked by OS.
>
> Although this should be used with care, synchronous transactions in a DB with transaction journal will require 2 IOPS
> minimum (probably 3-4 in practice) because of filesystem overhead, overhead depends on filesystem, not on record
> count or record size. In _libmdbx_ IOPS count will grow logarithmically depending on record count in DB (height of B+ tree)
> and will require at least 2 IOPS per transaction too.
3. [CoW](https://en.wikipedia.org/wiki/Copy-on-write)
for [MVCC](https://en.wikipedia.org/wiki/Multiversion_concurrency_control) is done on memory page level with [B+
trees](https://ru.wikipedia.org/wiki/B-%D0%B4%D0%B5%D1%80%D0%B5%D0%B2%D0%BE).
Therefore altering data requires to copy about Olog(N) memory pages, which uses [memory bandwidth](https://en.wikipedia.org/wiki/Memory_bandwidth) and is main performance bottleneck in `MAPASYNC` mode.
> This is unavoidable, but isn't that bad. Syncing data to disk requires much more similar operations which will
> be done by OS, therefore this is noticeable only if data sync to persistent storage is fully disabled.
> _libmdbx_ allows to safely save data to persistent storage with minimal performance overhead. If there is no need
> to save data to persistent storage then it's much more preferable to use `std::map`.
4. LMDB has a problem of long-time readers which degrades performance and bloats DB
> _libmdbx_ addresses that, details below.
5. _LMDB_ is susceptible to DB corruption in `WRITEMAP+MAPASYNC` mode.
_libmdbx_ in `WRITEMAP+MAPASYNC` guarantees DB integrity and consistency of data.
> Additionally there is an alternative: `UTTERLY_NOSYNC` mode. Details below.
#### Long-time read transactions problem
Garbage collection problem exists in all databases one way or another (e.g. VACUUM in PostgreSQL).
But in _libmdbx_ and LMDB it's even more important because of high performance and deliberate
simplification of internals with emphasis on performance.
* Altering data during long read operation may exhaust available space on persistent storage.
* If available space is exhausted then any attempt to update data
results in `MAP_FULL` error until long read operation ends.
* Main examples of long readers is hot backup
and debugging of client application which actively uses read transactions.
* In _LMDB_ this results in degraded performance of all operations
of syncing data to persistent storage.
* _libmdbx_ has a mechanism which aborts such operations and `LIFO RECLAIM`
mode which addresses performance degradation.
Read operations operate only over snapshot of DB which is consistent on the moment when read transaction started.
This snapshot doesn't change throughout the transaction but this leads to inability to reclaim the pages until
read transaction ends.
In _LMDB_ this leads to a problem that memory pages, allocated for operations during long read, will be used for operations
and won't be reclaimed until DB process terminates. In _LMDB_ they are used in
[FIFO](https://en.wikipedia.org/wiki/FIFO_(computing_and_electronics)) manner, which causes increased page count
and less chance of cache hit during I/O. In other words: one long-time reader can impact performance of all database
until it'll be reopened.
_libmdbx_ addresses the problem, details below. Illustrations to this problem can be found in the
[presentation](http://www.slideshare.net/leoyuriev/lmdb). There is also example of performance increase thanks to
[BBWC](https://en.wikipedia.org/wiki/Disk_buffer#Write_acceleration) when `LIFO RECLAIM` enabled in _libmdbx_.
#### Data safety in async-write mode
In `WRITEMAP+MAPSYNC` mode dirty pages are written to persistent storage by kernel. This means that in case of application
crash OS kernel will write all dirty data to disk and nothing will be lost. But in case of hardware malfunction or OS kernel
fatal error only some dirty data might be synced to disk, and there is high probability that pages with metadata saved,
will point to non-saved, hence non-existent, data pages. In such situation, DB is completely corrupted and can't be
repaired even if there was full sync before the crash via `mdbx_env_sync().
_libmdbx_ addresses this by fully reimplementing write path of data:
* In `WRITEMAP+MAPSYNC` mode meta-data pages aren't updated in place, instead their shadow copies are used and their updates
are synced after data is flushed to disk.
* During transaction commit _libmdbx_ marks synchronization points as steady or weak depending on how much synchronization
needed between RAM and persistent storage, e.g. in `WRITEMAP+MAPSYNC` commited transactions are marked as weak,
but during explicit data synchronization - as steady.
* _libmdbx_ maintains three separate meta-pages instead of two. This allows to commit transaction with steady or
weak synchronization point without losing two previous synchronization points (one of them can be steady, and second - weak).
This allows to order weak and steady synchronization points in any order without losing consistency in case of system crash.
* During DB open _libmdbx_ rollbacks to the last steady synchronization point, this guarantees database integrity.
For data safety pages which form database snapshot with steady synchronization point must not be updated until next steady
synchronization point. So last steady synchronization point creates "long-time read" effect. The only difference that in case
of memory exhaustion the problem will be immediately addressed by flushing changes to persistent storage and forming new steady
synchronization point.
So in async-write mode _libmdbx_ will always use new pages until memory is exhausted or `mdbx_env_sync()` is invoked. Total
disk usage will be almost the same as in sync-write mode.
Current _libmdbx_ gives a choice of safe async-write mode (default) and `UTTERLY_NOSYNC` mode which may result in full DB
corruption during system crash as with LMDB.
Next version of _libmdbx_ will create steady synchronization points automatically in async-write mode.
--------------------------------------------------------------------------------
Improvements over LMDB
================================================
1. `LIFO RECLAIM` mode:
The newest pages are picked for reuse instead of the oldest.
This allows to minimize reclaim loop and make it execution time independent of total page count.
This results in OS kernel cache mechanisms working with maximum efficiency.
In case of using disk controllers or storages with
[BBWC](https://en.wikipedia.org/wiki/Disk_buffer#Write_acceleration) this may greatly improve
write performance.
2. `OOM-KICK` callback.
`mdbx_env_set_oomfunc()` allows to set a callback, which will be called
in the event of memory exhausting during long-time read transaction.
Callback will be invoked with PID and pthread_id of offending thread as parameters.
Callback can do any of these things to remedy the problem:
* wait for read transaction to finish normally;
* kill the offending process (signal 9), if separate process is doing long-time read;
* abort or restart offending read transaction if it's running in sibling thread;
* abort current write transaction with returning error code.
3. Guarantee of DB integrity in `WRITEMAP+MAPSYNC` mode:
> Current _libmdbx_ gives a choice of safe async-write mode (default)
> and `UTTERLY_NOSYNC` mode which may result in full
> DB corruption during system crash as with LMDB. For details see
> [Data safety in async-write mode](#data-safety-in-async-write-mode).
4. Automatic creation of synchronization points (flush changes to persistent storage)
when changes reach set threshold (threshold can be set by `mdbx_env_set_syncbytes()`).
5. Ability to get how far current read-only snapshot is from latest version of the DB by `mdbx_txn_straggler()`.
6. `mdbx_chk` tool for DB checking and `mdbx_env_pgwalk()` for page-walking all pages in DB.
7. Control over debugging and receiving of debugging messages via `mdbx_setup_debug()`.
8. Ability to assign up to 3 markers to commiting transaction with `mdbx_canary_put()` and then get them in read transaction
by `mdbx_canary_get()`.
9. Check if there is a row with data after current cursor position via `mdbx_cursor_eof()`.
10. Ability to explicitly request update of present record without creating new record. Implemented as `MDBX_CURRENT` flag
for `mdbx_put()`.
11. Ability to update or delete record and get previous value via `mdbx_replace()` Also can update specific multi-value.
12. Support for keys and values of zero length, including sorted duplicates.
13. Fixed `mdbx_cursor_count()`, which returns correct count of duplicated for all table types and any cursor position.
14. Ability to open DB in exclusive mode with `MDBX_EXCLUSIVE` flag, e.g. for integrity check.
15. Ability to close DB in "dirty" state (without data flush and creation of steady synchronization point)
via `mdbx_env_close_ex()`.
16. Ability to get additional info, including number of the oldest snapshot of DB, which is used by one of the readers.
Implemented via `mdbx_env_info()`.
17. `mdbx_del()` doesn't ignore additional argument (specifier) `data`
for tables without duplicates (without flag `MDBX_DUPSORT`), if `data` is not zero then always uses it to verify
record, which is being deleted.
18. Ability to open dbi-table with simultaneous setup of comparators for keys and values, via `mdbx_dbi_open_ex()`.
19. Ability to find out if key or value is in dirty page. This may be useful to make a decision to avoid
excessive CoW before updates. Implemented via `mdbx_is_dirty()`.
20. Correct update of current record in `MDBX_CURRENT` mode of `mdbx_cursor_put()`, including sorted duplicated.
21. All cursors in all read and write transactions can be reused by `mdbx_cursor_renew()` and MUST be freed explicitly.
> ## Caution, please pay attention!
>
> This is the only change of API, which changes semantics of cursor management
> and can lead to memory leaks on misuse. This is a needed change as it eliminates ambiguity
> which helps to avoid such errors as:
> - use-after-free;
> - double-free;
> - memory corruption and segfaults.
22. Additional error code `MDBX_EMULTIVAL`, which is returned by `mdbx_put()` and
`mdbx_replace()` in case is ambiguous update or delete.
23. Ability to get value by key and duplicates count by `mdbx_get_ex()`.
24. Functions `mdbx_cursor_on_first() and mdbx_cursor_on_last(), which allows to know if cursor is currently on first or
last position respectively.
25. If read transaction is aborted via `mdbx_txn_abort()` or `mdbx_txn_reset()` then DBI-handles, which were opened in it,
aren't closed or deleted. This allows to avoid several types of hard-to-debug errors.
26. Sequence generation via `mdbx_dbi_sequence()`.
27. Advanced dynamic control over DB size, including ability to choose page size via `mdbx_env_set_geometry()`,
including on Windows.
28. Three meta-pages instead of two, this allows to guarantee consistently update weak sync-points without risking to
corrupt last steady sync-point.
29. Automatic reclaim of freed pages to specific reserved space at the end of database file. This lowers amount of pages,
loaded to memory, used in update/flush loop. In fact _libmdbx_ constantly performs compactification of data,
but doesn't use additional resources for that. Space reclaim of DB and setup of database geometry parameters also decreases
size of the database on disk, including on Windows.
--------------------------------------------------------------------------------
```
$ objdump -f -h -j .text libmdbx.so
@ -474,16 +597,3 @@ Idx Name Size VMA LMA File off Algn
CONTENTS, ALLOC, LOAD, READONLY, CODE
```
```
$ gcc -v
Using built-in specs.
COLLECT_GCC=gcc
COLLECT_LTO_WRAPPER=/usr/lib/gcc/x86_64-linux-gnu/7/lto-wrapper
OFFLOAD_TARGET_NAMES=nvptx-none
OFFLOAD_TARGET_DEFAULT=1
Target: x86_64-linux-gnu
Configured with: ../src/configure -v --with-pkgversion='Ubuntu 7.2.0-8ubuntu3' --with-bugurl=file:///usr/share/doc/gcc-7/README.Bugs --enable-languages=c,ada,c++,go,brig,d,fortran,objc,obj-c++ --prefix=/usr --with-gcc-major-version-only --program-suffix=-7 --program-prefix=x86_64-linux-gnu- --enable-shared --enable-linker-build-id --libexecdir=/usr/lib --without-included-gettext --enable-threads=posix --libdir=/usr/lib --enable-nls --with-sysroot=/ --enable-clocale=gnu --enable-libstdcxx-debug --enable-libstdcxx-time=yes --with-default-libstdcxx-abi=new --enable-gnu-unique-object --disable-vtable-verify --enable-libmpx --enable-plugin --enable-default-pie --with-system-zlib --with-target-system-zlib --enable-objc-gc=auto --enable-multiarch --disable-werror --with-arch-32=i686 --with-abi=m64 --with-multilib-list=m32,m64,mx32 --enable-multilib --with-tune=generic --enable-offload-targets=nvptx-none --without-cuda-driver --enable-checking=release --build=x86_64-linux-gnu --host=x86_64-linux-gnu --target=x86_64-linux-gnu
Thread model: posix
gcc version 7.2.0 (Ubuntu 7.2.0-8ubuntu3)
```